国立爱丽丝研究机关学园本部不同于一般的学园，只招收具备特殊能力的学生，这种能力被称之为“爱丽丝”。因为好友今井萤（钉宫理惠配音）转学从乡间来到了城里的爱丽丝学园，无论如何也不想和萤分开的佐仓蜜柑（植村加奈配音）因此离家出走，跟随萤来到了学园。但没有超能力的她根本无法进入，被学院老师鸣海先生（石田彰配音）救助后，意外地开发了蜜柑的超能力，于是，机缘巧合下，蜜柑也进入了爱丽丝学园，达成了她和萤在一...

　　故事发生在名为创圣学院的学校之中，这个学校被分为男校和女校两个学部，女学部的秉性的是严肃的传统名门院校的学风，而男学部则崇尚开化和革新。泉户裕理（日野聪配音）就是在男学部就读的一名普通学生，与此同时，他的父亲是八衢神社宫的主人x战警第一战2　　一天，正在进行装修的学校操场地下挖出了一处刻有奇异文字的遗迹，虽然校方认为这并不是什么具有考古价值的遗迹，打算继续施工，但裕理却发现了其中的古怪。入夜，...